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专利申请权转让是指专利申请人将国家知识产权局已接收但仍未授权的专利依法转让给他人的行为。需要注意的是，专利申请权转让后，让与人转让的只是受让人有权针对此专利继续进行申请的权利，不能从根本上保证受让人未来一定能够成为受让发明创造的专利权人。
一项发明创造的专利申请权转让后，让与人不能再就同一发明创造自己提出专利申请，也无权再将该发明创造的专利申请权转让给第三人；在受让人专利申请被驳回之前，让与人不得将该发明创造用于营利性的生产活动，但以非营利为目的的善意使用，不受限制，如利用该发明创造为科学研究和实验服务。
1、签订转让合同。专利申请权转让合同，是指转让方将其发明创造申请专利的权利转让给受让方，而受让方支付约定的价款所订立的合同。专利申请权转让合同的主要条款包括：合同名称、发明创造名称、发明创造种类、发明人或者设计人、技术情报和资料清单、专利申请被驳回的责任、价款及其支付方式、违约金损失赔偿额的计算方法、争议的解决办法等。
2、到专利局办理登记手续，并由专利局公告，合同自登记之日起生效。
3、另外需要注意的是，若专利申请人为两个或者两个以上的人，专利申请权的转让必须经全体权利人同意;中国单位或者个人向外国人转让专利申请权或者专利权的，必须经国务院对外经济贸易主管部门会同国务院科学技术行政部门批准。
对于已在国家知识产权局登记的专利申请权转让，可以请求国家知识产权局出具"专利申请权转让证明"。专利申请权转让证明只向专利申请的权利人出具。办理专利申请权转让证明需交纳相应费用并根据以下情况提交相应文件：
1、申请人或代理人办理专利申请权转让证明的，需提交申请人或代理机构签章的"办理文件副本请求书"。
2、申请人当面办理的，需提供本人身份证明。委托他人办理的，需要提供经办人身份证明、委托关系证明和申请人身份证明。
3、申请人以邮寄方式办理的，需要提交申请人身份证明。申请人委托他人以邮寄方式办理的，需要提交委托关系证明、经办人身份证明和申请人身份证明。
根据《专利法》第10条的规定，专利申请权可以转让。根据《专利法》的规定，转让专利申请权，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。中国的单位与个人向外国人转让专利申请权的，还必须经国务院有关主管部门批准。专利申请权转让自登记公告之日起生效。
根据《合同法》和《专利法》的相关规定，专利申请权转让合同的主体主要是：
(1)非职务发明创造的发明人或者设计人。
(2)职务发明创造的发明人或者设计人所在单位。
(3)委托开发的研究开发单位或按约定取得专利申请权的委托单位。
(4)合作研究开发的共同完成单位或按约定取得专利申请权的单位。
(一)签订专利申请权转让合同后受让人如何应对侵权行为
当事人双方签订专利申请权转让合同后，如果国家知识产权局未对该转让进行公告，则受让人还不能以专利权人的身份阻止他人侵权；如果转让进行了公告，但专利申请还未授予专利权，受让人可以要求未经允许实施其专利的人支付一定的使用费，但仍然不能对侵权人提起诉讼，如果对方拒绝付费，只有等到授予专利权之后才能行使诉讼的权利。所以，即使专利申请权转让最终生效，受让人对侵权行为的打击仍然是有限定范围的，只有受让人真正成为专利权人时才拥有全方位的专利权保护。
(二)专利申请权转让的登记
与专利权转让登记相同，专利申请权转让合同签订后3个月内，必须要向国家知识产权局办理著录事项变更手续。
(三)专利申请权转让的风险承担
专利申请权转让后，专利申请既可能被授予专利权，也可能被驳回。如果被驳回，让与人将不再返还转让费。受让人应该清楚地预见到专利申请可能被驳回的风险，受让人同意签订专利申请权转让合同，等于接受了承担风险的责任。除非让与人恶意欺骗，一般情况下受让人不得要求返还转让费。
(四)共有专利申请权和专利权的转让问题
在实践中，当专利申请人或专利权人是两个或两个以上时，一般应当由所有申请人或者专利权人共同协商，共同进行转让，全部在转让合同上签字或盖章并且在转让权利请求书上签字或盖章。这其中可以推选代表人，国家知识产权局将直接和代表人联系相关问题，代表人的决定视为已经过全部申请人同意。一部分申请人转让专利申请权或者一部分专利权人转让专利权是无效的。
案例1：
1993年2月4日天津市医药工业技术研究所向国家知识产权局申请治疗冠心病、心绞痛的中药新药“，心苏明胶囊”发明专利，发明人为顾云、康盛世、马惠文、张玉珠。同时提交了发明专利申请早期公开说明书。1993年4月13日，天津市医药工业技术研究所与广州市花城制药厂签订心苏明胶囊技术转让协议。双方约定：天津市医药工业技术研究所转让心苏明胶囊的品种、处方、生产工艺等；广州市花城制药厂向天津市医药工业技术研究所支付心苏明胶囊技术转让费120万元，天津市医药工业技术研究所心苏明胶囊只能在国内两地各转让一家进行生产，不得以任何方式转让或变相转让。上述协议已办理技术合同认证登记。①因为该专利还没有被授权，所以此则案例是专利申请权转让，它与专利权转让相类似，很容易混淆。
案例2：
辨析：专利申请权转让与专有技术转让有何区别呢?下面我们来看一个案例。1987年6月，原告上海大华化轻工业公司(简称大华公司)与被告无锡某研究院院长孔德凯签订了一份“转让安全节能电镀循环过滤加热器专利申请权合同”，双方约定：孔德凯将其非职务发明“安全节能电镀循环过滤加热器”的专利申请权转让给大华公司，由大华公司自主办理专利申请，孔德凯放弃专利申请权，(即使大华公司只实施未申请专利，孔德凯也不提出申请)；大华公司支付给孔德凯专利申请权转让费10万元，其中，合同签约后预付5万元，合同公证后补付5万元；合同签字生效后，即由大华公司到公证机构办理公证手续。合同还约定，以后不论大华公司在生产中的经济效益如何，孔德凯无权再要求大华公司支付报酬，亦不承担经济退回风险。合同签订后，大华公司分两次支付给孔德凯转让费6万元，但未按合同规定办理公证手续。孔德凯认为大华公司未按约支付转让费，便于1987年7月向中国专利局提出专利申请。1988年6月，孔德凯申请的专利经中国专利局公告。据此，大华公司向上海市中级人民法院起诉，要求孔德凯返还转让费6万元，并赔偿违约金1万元。
本案虽然合同中写明的是“转让安全节能电镀循环过滤加热器专利申请权合同”，但是技术所有人在签订转让合同前并未向国家知识产权局提出此技术的专利申请，而是在转让合同签订后才办理申请事宜，所以从本质上来说，本案中双方转让的并非专利申请权而是非专利技术即专有技术。两者的界限就在于是否已向国家知识产权局提出专利申请。专有技术必须是采取保密措施的技术。
案例3：
1993年5月27日，赵英俊将自己在工作实践中研制的“一次性多头加药器”向国家专利局提出专利申请。1993年6月10日，国家专利局向赵英俊发出了专利受理通知书，确定的申请号为933032803。1993年8月17日，赵英俊经与长春市佳林医用塑料制品有限公司(以下简称佳林公司)协商，决定将该项专利申请权转让给佳林公司，双方签订了专利申请权转让合同。合同约定，赵英俊将“一次性多头加药器”的专利申请权转给佳林公司；佳林公司付给赵英俊转让费10万元，1993年8月24日前支付5000元，余款95，000元于长春市专利事务所接到授权通知书之日起15日内支付；本合同生效之日起，由中介方长春市专利事务所办理专利申请人变更手续；佳林公司如未按期支付给赵英俊95，000元，本合‘同终止，由赵英俊到国家专利局办理专利权变更手续。合同签订后，佳林公司按合同约定的期限给付赵英俊5000元。赵英俊也按合同约定于8月24日将受理通知书、外观设计专利申请书、一次性多头加药器设计图、外观设计简要说明及外观设计图等全部交付佳林公司。1993年12月4日，国家专利局向长春市专利事务所发出了授予申请人为长春市佳林医用塑料制品有限公司的“一次性多头加药器”专利权决定通知书。收到该决定通知书后，佳林公司未按照合同规定给付赵英俊其余的95，000元转让费。为此，原告赵英俊向长春市中级人民法院提起诉讼称：被告佳林公司未按合同约定在接到受理通知书之日起15日内支付转让费95，000元，请求被告按合同第9条第2款约定，将“一次性多头加药器”专利权归还本人。
本案是一起专利申请权转让合同纠纷，涉及的问题是在专利一方发生违约，是否应该归还专利权?专利申请权的转让必须签订书面的转让合同并向国家知识产权局进行著录事项变更手续，经国家知识产权局登记并公告之后才真正产生法律效力。本案中，赵英俊将已被受理的“一次性多头加药器”专利申请权转让给佳林公司，双方签订了转让协议，合同中亦明确规定转让费为10万元。佳林公司未按合同约定给付足够的转让费用，属于违约行为，按照合同法的有关规定应返还该专利。赵英俊可以依据法院判决向国家知识产权局再次办理著录事项变更手续，使之成为真正的专利所有权人。