1、作为惩戒方式，它们的类别、审批时效不同。开除是属于行政处分，而且是最严厉的一种处分。其处理时效为：从证实职工犯错误之日起5个月之内审批完毕。违纪辞退属于行政处理，不属行政处分之列。因此对它们没有具体的审批时效规定，但原则要求应对犯错误职工及时进行处理，不得无故拖延处理时间。
2、作为惩戒方式，它们的适用对象及其条件不同。开除处分适用于严重违法乱纪的职工，主要包括以下几种情况：
①被判刑并入监服刑的;
②二次劳教被注销城市户口的;
③留用察看期间表现仍不好的;
④严重犯有《企业职工奖惩条例》第十一条所列七项错误行为之一的。
违纪辞退则适用于犯有《国营企业辞退违纪职工暂行规定》第二条所列七项错误行为之一，且经教育或行政处分无效的职工。一般是指那些大错不犯、小错不断的职工，他们所犯错误程序既够不上开除、也够不上除名。
3、作为惩戒方式，它们的实施程序不同。开除处分，按《企业职工奖惩条例》规定，应由厂长或者经理提出，由职工代表大会讨论决定。违纪辞退，按照《国营企业辞退违纪职工暂行规定》，应由车间、科室提出职工违纪的证据和处理意见，在听取工会意见后，由厂长(经理)决定予以辞退。