消毒剂的种类非常多，不同的品种在养殖中使用的时机也不同。
1 生石灰。
这个是一个传统的，但是效果非常好的消毒剂。主要是用在场地地面的消毒。可以减少鸡主要活动场地中的病原菌，清除地面，墙壁缝隙中残存的虫卵等的危害。
除了生石灰，地面消毒使用火碱也很普遍，效果也不错。
2 福尔马林。
高锰酸钾和甲醛以1：2的比例使用，主要用于鸡舍等位置的整体消毒，消毒效果不错。这也是比较传统的消毒方式，现在逐渐已经退出市场。主要是鸡舍会残存甲醛等有害气体，等鸡雏进入以后，鸡舍升温，这些残存的甲醛挥发，会刺激鸡的呼吸系统。同时，对人的危害也很大，使用不方便。
3 二氯异氰尿酸钠
鸡舍空舍消毒一种比较常见的消毒剂，这种消毒剂很快挥发，对场地残存危害不大，但是很容易出现消毒不彻底等情况。
4 聚维酮碘。
比较常见的消毒剂，刺激性比较小，可以带鸡消毒，类似的产品还有百毒杀等。
除了这些消毒剂，还有一些中成药的成分组成的烟雾弹，以及水线消毒的酸化剂等，总之消毒剂的种类非常多，根据养殖的不同时期，采用不同消毒剂进行消毒。